高校思想政治理论课教学是一项系统性很强的工作，需要各个环节的密切配合与有机联结。为此，应当增强问题意识，坚持问题导向，提高思想政治理论课教学的系统性、针对性、实效性。概括地说，高校思想政治理论课教学问题有三类，即理论认识问题、教学方法问题、教师意识问题，分别关注教学目标、教学手段、教学保障问题。根据这三类问题，《理论、方法与意识：高校思想政治理论课教学问题研究》分为三个部分，共设十章。
　　第一部分阐述高校思想政治理论课教学的相关理论认识问题，分别涵盖马克思主义哲学、政治经济学、科学社会主义理论，集中阐释马克思主义与中国传统文化的融合、创新及发展，马克思主义政治经济学的历史使命与当代价值，我国社会主义初级阶段的历史定位及发展趋势等重大理论与实践问题。这一部分包括第一章至第五章，各章题目依次是：人学与科学：中国儒家文化与马克思主义的碰撞与融合。和谐价值观：中国传统和谐思想的弘扬与发展。《资本论》的理论特色与著述风格――兼析马克思主义经济学与西方经济学的区别，中国特色社会主义政治经济学：马克思主义政治经济学的创新与发展，中国社会主义初级阶段历史定位的基本坐标。
　　第二部分探讨高校思想政治理论课教学方法问题，具体阐释教学体系、教学特性、教学模式、教学设计等方面的改革与创新。这一部分包括第六至九章，各章题目依次是：完善高校马克思主义理论教育体系――在大学生中普及马克思主义的思考，正确认识思想政治理论课教学的基本特性及其关系，提高思想政治理论课课堂教学实效的五个转变。六问法：高校思想政治理论课突出问题导向的探索。
　　第三部分探析高校思想政治理论课教师主体意识问题。提高高校思想政治理论课教学实效性的关键在于思想政治理论课教师具有主体意识，履行主体责任，发挥主体作用，从而为思想政治理论课教育教学提供坚实基础和可靠保障。这一部分包括第十章，题目是：《高校思想政治理论课教师主体意识培养探析》。