佛罗里达州男孩雅各布的爷爷离奇死去，留下支离破碎的怪异遗言。雅各布虽亲眼看见凶手，但同行的朋友却坚称没有看到。加之爷爷生前所讲的离奇故事以及所留下的照片，雅各布陷入了深深的困惑和担忧。但当他讲述所见事实，没有人相信，甚至将他送去进行精神治疗。
为了找出真相，为了证明自己是个正常人，为了证明自己对至亲的爷爷的信任没有错，他远赴威尔士，由此展开惊心动魄的时光穿越之旅并发现了一群天生异秉的孩子以及自己的异能人身份。
原来，雅各布的异能在于他可以看见并且杀死“影子杀手”，他是异能人的保护者。当1940年9月3日时光圈被毁，孤儿院被炸，院长被俘，雅各布面临两难选择，要么跟父亲回家过从前被误解及时刻被幽灵跟踪的生活，要么离开父母，留在时光圈里，保护异能孩子们。
他选择了后者，并与父亲匆忙告别。他**次杀掉幽灵，并陪同异能孩子们在起了风暴的大海上出逃，寻找拯救院长的出路。而他的父亲则要从此面对儿子莫名失踪的痛苦，雅各布自己也因此时时愧疚。当他带领异能孩子到达拯救院长之地，却不知更大的灾祸等着他们。敌人已经布置好了陷阱，等待围捕所有的异能人。