疾病考古是运用古病理学方法对人类遗骸所表现的疾病和创伤进行科学鉴定，并借助文献资料、图像和出土遗物对相关人群的社群关系、生业模式和文化习俗进行综合分析的学科。本文综合分析了已公布的38处新疆青铜时代与早期铁器时代墓地与遗址的人骨材料，按地理概念划分为阿尔泰山、天山、昆仑山3个单元，结合自然环境与历史背景，对创伤、齿科疾病、先天畸形、肿瘤、关节疾病、呼吸系统疾病、传染性疾病、新陈代谢与内分泌疾病，以及颅骨变形、钻孔、头骨环锯等现象进行研究，客观反映这一时期新疆地区的人地关系与族群冲突。

本书在前人研究的基础上，对新疆青铜时代至早期铁器时代疾病考古成果进行梳理、归纳和总结，并结合社会、经济、文化背景，探讨疾病及特殊墓葬现象（颅骨变形、头骨环切）产生的地域因素和性别差异。此外，书中还涉及新疆古代先民的部分医疗活动，包括外科手术、麻醉剂、骨折处理、假肢安装、巫术医疗及药物的相关内容。