《南京通史》由南京市地方志编纂委员会办公室组织编撰，邀请全国历史学、人类学、社会学、考古学、哲学、民俗学、人类学、地理学等学科专家学者进行选题论证和审稿，邀请江苏省历史学科近三十位专家学者参与撰写，包括贺云翱、胡阿祥、范金民、夏维中、卢海鸣等。

全书以中国历史时序排列分为史前时代至秦汉卷、六朝卷、隋唐五代宋元卷、明代卷、清代卷、民国卷、共和国卷（19492000）和综合卷共8卷约450万字。

全书围绕治乱兴衰经济发展国家控制社会结构精神文化社会生活等方面展开以专题形式叙史，展示了南京深厚的历史积淀和文化意义。

《南京通史》的出版，将填补南京地区城市史研究的学术空白。