《质谱分析实验指南》的目的是使质谱技术能够灵活应用于生命科学，明确质谱技术能够做什么？为此，作者主要从技术和方法层面入手，图文并茂，显浅易明，通俗易懂。从仪器选择，样品制备，技术路线，到分析方法要点，进行了详细的介绍。首先，一是采用质谱分析技术"发现"未知因子，包括配体结合蛋白的发现，翻译后修饰蛋白的检出和鉴定，产生变化蛋白的发现，疾病生物标志物的发现；采用CE/MS技术发现抑郁症血液生物标志物为实例。微生物菌种的快速鉴定等。二是采用质谱分析技术"定量"已知因子，包括检测氨基酸 通过血浆游离氨基酸轮廓早期发现癌症的方法，检测酸性磷脂，检测小RNA，检测气体分子；以硫醇为探针检测H2S及其定量，检测细胞的能量代谢；低氧环境下代谢物的定量，检测细胞的氧化应急；以亲电子化合物8-nitro-cGMP定量为实例，检测蛋白质的"结构变化"等。三是采用质谱成像技术对组织/细胞"可视化"，包括细胞的"能量代谢"成像，在慢性炎症组织中的磷脂分子成像，"药物动态"成像，细胞 亚细胞结构的代谢伴随着细胞动态的观察等。通过基础篇和实践篇的对应关系，完成从基础理论到实际应用的过程，也完成了对MS这个复杂高端仪器的广泛普及应用过程。