《近代中国与东南亚关系史》论述17世纪中叶至20世纪初中国与东南亚关系史。它关注越、老、缅、暹和苏禄与清朝的朝贡关系，探讨朝贡活动停止的真正原因。在东南亚国家相继沦为殖民地的过程中，《近代中国与东南亚关系史》关注清政府对西方殖民者侵略东南亚国家的反应，探讨中国与西方国家在东南亚的殖民地贸易关系的性质。近代中国与东南亚国家社会运动的相互影响、清政府在东南亚的设领护侨活动，也是《近代中国与东南亚关系史》研究的重要问题。